2023年高等教育司工作的总体思路是：以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻、落实党的二十大精神，把握高等教育发展的新定位、新部署、新要求、新任务，加快新工科、新医科、新农科、新文科建设，以高等教育强国建设为目标，以全面提高人才自主培养质量为主线，以深入推进高等教育综合改革试点为抓手，探索构建中国式高等教育发展模式，更好服务国家区域经济社会发展。
一、推动高等教育体制机制创新和高质量发展
二、加强基础学科人才培养，着力造就拔尖创新人才
三、实施系列“101计划”，全面推进教育教学改革
四、全面深化“四新”建设，完善和发展人才自主培养新范式
五、深入实施数字化战略行动，塑造高等教育改革发展新优势
六、加强课程思政高质量建设，推动形成育人新成效
发展大学生文化素质教育，深入挖掘各类专业课程和教学方式中蕴含的思想政治教育资源，破解课程思政“表面化”“硬融入”问题。结合专业特点分类推进课程思政建设，将党的二十大精神有机融入相关专业课程。细化普通本科专业类课程思政教学指南，完善专业类、专业、课程不同层面课程思政教学重点。推进课程思政优质资源数字化转化和共享，用好示范项目和数字化资源，开展相关课程任课教师培训，提升教师课程思政教学能力。
七、深化高校创新创业教育改革，增强学生“敢闯会创”素质能力
八、推动振兴中西部高等教育走深走实，全面提升高等教育整体质量
九、加强直属高校工作，加快推进一流大学群体建设
十、完善部省校协同联动工作机制，形成高等教育高质量发展合力
十一、擦亮党建工作特色品牌，推进党建业务融合创新